1.    柱塞泵的活塞和泵體之間存在縫隙，柱塞泵通過活塞擠壓，讓高速流量藥液通過/入小孔徑通路時，所產生的剪切力Shear force可能會對剪切力敏感的某些生物產品產生潛在影響。
   2.    如果產品粘度較高，柱塞泵在活塞擠壓藥液時，容易產生內腔較大的壓力，在微量灌裝時這種壓力容易影響灌裝精度，而蠕動泵相比而言，灌裝壓力相對較低。
   3.    有些產品對金屬部件存在反應，那么無金屬部件的一次包材所構成的灌裝套件也避免了藥液與金屬的接觸。